MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli SMS-3-5 plasmid pSMS35_4

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010486	TAAAA	2	10	90	99	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010486	GGGA	2	8	151	158	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010486	ATTC	2	8	337	344	25 %	50 %	0 %	25 %	170650755
4	NC_010486	GAG	2	6	441	446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170650755
5	NC_010486	AT	3	6	574	579	50 %	50 %	0 %	0 %	170650755
6	NC_010486	AAG	2	6	590	595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650755
7	NC_010486	CTC	2	6	618	623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650755
8	NC_010486	CAG	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650755
9	NC_010486	TAT	2	6	650	655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650755
10	NC_010486	GAT	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650755
11	NC_010486	ATT	2	6	728	733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170650755
12	NC_010486	A	7	7	759	765	100 %	0 %	0 %	0 %	170650755
13	NC_010486	ACAA	2	8	841	848	75 %	0 %	0 %	25 %	170650755
14	NC_010486	T	8	8	904	911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010486	A	7	7	974	980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010486	G	7	7	993	999	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010486	TGT	2	6	1027	1032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010486	GT	3	6	1031	1036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010486	CTT	2	6	1038	1043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010486	GAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010486	ATG	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010486	AAAAC	2	10	1088	1097	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010486	CCT	2	6	1138	1143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650752
24	NC_010486	GT	3	6	1153	1158	0 %	50 %	50 %	0 %	170650752
25	NC_010486	CGC	2	6	1175	1180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650752
26	NC_010486	AGCG	2	8	1208	1215	25 %	0 %	50 %	25 %	170650752
27	NC_010486	GAT	2	6	1221	1226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
28	NC_010486	GT	3	6	1242	1247	0 %	50 %	50 %	0 %	170650752
29	NC_010486	GCA	2	6	1253	1258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
30	NC_010486	TGA	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
31	NC_010486	ACA	2	6	1457	1462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170650752
32	NC_010486	AG	3	6	1469	1474	50 %	0 %	50 %	0 %	170650752
33	NC_010486	AAGCTG	2	12	1498	1509	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170650752
34	NC_010486	CCTT	2	8	1581	1588	0 %	50 %	0 %	50 %	170650752
35	NC_010486	ATGGC	2	10	1599	1608	20 %	20 %	40 %	20 %	170650752
36	NC_010486	TGGC	3	12	1605	1616	0 %	25 %	50 %	25 %	170650752
37	NC_010486	TCT	2	6	1619	1624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650752
38	NC_010486	TGT	2	6	1676	1681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650752
39	NC_010486	CAG	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
40	NC_010486	GTG	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170650752
41	NC_010486	GTTC	2	8	1845	1852	0 %	50 %	25 %	25 %	170650752
42	NC_010486	GCT	2	6	1998	2003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650752
43	NC_010486	CG	3	6	2017	2022	0 %	0 %	50 %	50 %	170650752
44	NC_010486	ACG	2	6	2023	2028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
45	NC_010486	TCC	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170650752
46	NC_010486	CTG	2	6	2116	2121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650752
47	NC_010486	GCC	2	6	2252	2257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650752
48	NC_010486	GAT	2	6	2300	2305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
49	NC_010486	T	6	6	2305	2310	0 %	100 %	0 %	0 %	170650752
50	NC_010486	GGCT	2	8	2313	2320	0 %	25 %	50 %	25 %	170650752
51	NC_010486	CTTC	2	8	2334	2341	0 %	50 %	0 %	50 %	170650752
52	NC_010486	CAT	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650752
53	NC_010486	GAT	2	6	2455	2460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
54	NC_010486	GT	3	6	2469	2474	0 %	50 %	50 %	0 %	170650752
55	NC_010486	CGG	2	6	2522	2527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170650752
56	NC_010486	CGC	2	6	2613	2618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650752
57	NC_010486	ATG	2	6	2772	2777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
58	NC_010486	GTT	2	6	2803	2808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170650752
59	NC_010486	CAG	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
60	NC_010486	ATG	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
61	NC_010486	CTGA	2	8	2926	2933	25 %	25 %	25 %	25 %	170650752
62	NC_010486	TTC	2	6	3032	3037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170650752
63	NC_010486	CAGG	2	8	3089	3096	25 %	0 %	50 %	25 %	170650752
64	NC_010486	AGTC	2	8	3157	3164	25 %	25 %	25 %	25 %	170650752
65	NC_010486	TCA	2	6	3173	3178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650752
66	NC_010486	GCA	2	6	3203	3208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650752
67	NC_010486	GAT	2	6	3241	3246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
68	NC_010486	GAT	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170650752
69	NC_010486	TTTC	2	8	3299	3306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010486	CA	3	6	3321	3326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010486	CAT	2	6	3448	3453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170650753
72	NC_010486	AGA	2	6	3471	3476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170650753
73	NC_010486	TGCTGA	2	12	3478	3489	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	170650753
74	NC_010486	GCA	2	6	3557	3562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170650753
75	NC_010486	GGA	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170650753
76	NC_010486	CGC	2	6	3721	3726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170650754
77	NC_010486	AGCG	2	8	3747	3754	25 %	0 %	50 %	25 %	170650754
78	NC_010486	T	6	6	3897	3902	0 %	100 %	0 %	0 %	170650754
79	NC_010486	T	6	6	3924	3929	0 %	100 %	0 %	0 %	170650754
80	NC_010486	TCG	2	6	3959	3964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170650754

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.